Protein–RNA interactions for Protein: A6NDA9

LRIT2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT2A6NDA9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIT2A6NDA9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIT2A6NDA9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRIT2A6NDA9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRIT2A6NDA9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
LRIT2A6NDA9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRIT2A6NDA9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRIT2A6NDA9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRIT2A6NDA9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRIT2A6NDA9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRIT2A6NDA9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIT2A6NDA9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms