Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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EDEM3Q9BZQ6 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
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EDEM3Q9BZQ6 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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EDEM3Q9BZQ6 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.53□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC2.53□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.53□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.53□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC2.53□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.53□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.53□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC2.53□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC2.53□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.53□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.53□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.53□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC2.53□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.53□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.53□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.53□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC2.53□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.53□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC2.53□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.53□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.53□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
EDEM3Q9BZQ6 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
EDEM3Q9BZQ6 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
EDEM3Q9BZQ6 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
EDEM3Q9BZQ6 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
EDEM3Q9BZQ6 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
EDEM3Q9BZQ6 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
EDEM3Q9BZQ6 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
EDEM3Q9BZQ6 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
EDEM3Q9BZQ6 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
EDEM3Q9BZQ6 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
EDEM3Q9BZQ6 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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