Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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USP43Q70EL4 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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USP43Q70EL4 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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USP43Q70EL4 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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USP43Q70EL4 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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USP43Q70EL4 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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USP43Q70EL4 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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