Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf47Q6ZRZ4 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.5 ms