Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
COL5A1-AS1Q5SY13 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL5A1-AS1Q5SY13 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL5A1-AS1Q5SY13 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL5A1-AS1Q5SY13 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL5A1-AS1Q5SY13 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL5A1-AS1Q5SY13 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL5A1-AS1Q5SY13 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL5A1-AS1Q5SY13 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL5A1-AS1Q5SY13 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL5A1-AS1Q5SY13 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL5A1-AS1Q5SY13 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL5A1-AS1Q5SY13 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL5A1-AS1Q5SY13 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL5A1-AS1Q5SY13 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL5A1-AS1Q5SY13 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL5A1-AS1Q5SY13 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL5A1-AS1Q5SY13 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL5A1-AS1Q5SY13 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL5A1-AS1Q5SY13 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL5A1-AS1Q5SY13 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL5A1-AS1Q5SY13 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL5A1-AS1Q5SY13 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL5A1-AS1Q5SY13 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL5A1-AS1Q5SY13 MORN2-202ENST00000409077 465 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL5A1-AS1Q5SY13 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL5A1-AS1Q5SY13 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL5A1-AS1Q5SY13 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL5A1-AS1Q5SY13 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL5A1-AS1Q5SY13 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL5A1-AS1Q5SY13 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL5A1-AS1Q5SY13 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL5A1-AS1Q5SY13 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL5A1-AS1Q5SY13 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL5A1-AS1Q5SY13 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL5A1-AS1Q5SY13 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL5A1-AS1Q5SY13 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL5A1-AS1Q5SY13 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL5A1-AS1Q5SY13 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL5A1-AS1Q5SY13 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
COL5A1-AS1Q5SY13 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
COL5A1-AS1Q5SY13 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
COL5A1-AS1Q5SY13 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
COL5A1-AS1Q5SY13 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
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COL5A1-AS1Q5SY13 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
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COL5A1-AS1Q5SY13 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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COL5A1-AS1Q5SY13 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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COL5A1-AS1Q5SY13 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
COL5A1-AS1Q5SY13 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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COL5A1-AS1Q5SY13 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
COL5A1-AS1Q5SY13 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
COL5A1-AS1Q5SY13 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
COL5A1-AS1Q5SY13 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
COL5A1-AS1Q5SY13 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
COL5A1-AS1Q5SY13 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
COL5A1-AS1Q5SY13 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
COL5A1-AS1Q5SY13 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
COL5A1-AS1Q5SY13 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
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