Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
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