Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
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