Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
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