Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRADDQ15628 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRADDQ15628 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRADDQ15628 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRADDQ15628 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRADDQ15628 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRADDQ15628 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRADDQ15628 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRADDQ15628 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRADDQ15628 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRADDQ15628 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRADDQ15628 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRADDQ15628 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRADDQ15628 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRADDQ15628 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRADDQ15628 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRADDQ15628 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.6 ms