Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PUM3Q15397 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
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