Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KARSQ15046 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KARSQ15046 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KARSQ15046 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KARSQ15046 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KARSQ15046 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KARSQ15046 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KARSQ15046 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KARSQ15046 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KARSQ15046 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KARSQ15046 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KARSQ15046 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KARSQ15046 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KARSQ15046 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KARSQ15046 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KARSQ15046 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KARSQ15046 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KARSQ15046 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KARSQ15046 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KARSQ15046 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KARSQ15046 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KARSQ15046 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KARSQ15046 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KARSQ15046 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KARSQ15046 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KARSQ15046 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KARSQ15046 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KARSQ15046 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KARSQ15046 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KARSQ15046 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KARSQ15046 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KARSQ15046 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KARSQ15046 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KARSQ15046 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KARSQ15046 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KARSQ15046 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KARSQ15046 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KARSQ15046 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KARSQ15046 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KARSQ15046 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KARSQ15046 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KARSQ15046 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KARSQ15046 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KARSQ15046 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KARSQ15046 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KARSQ15046 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KARSQ15046 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KARSQ15046 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KARSQ15046 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
KARSQ15046 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KARSQ15046 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KARSQ15046 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KARSQ15046 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KARSQ15046 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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