Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC0.35□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.32□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC0.32□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SHPRHQ149N8 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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