Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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RAB39AQ14964 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
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RAB39AQ14964 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
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