Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RRP1BQ14684 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RRP1BQ14684 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RRP1BQ14684 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RRP1BQ14684 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RRP1BQ14684 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RRP1BQ14684 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RRP1BQ14684 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RRP1BQ14684 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RRP1BQ14684 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RRP1BQ14684 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RRP1BQ14684 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RRP1BQ14684 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RRP1BQ14684 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RRP1BQ14684 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RRP1BQ14684 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RRP1BQ14684 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RRP1BQ14684 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RRP1BQ14684 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RRP1BQ14684 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RRP1BQ14684 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RRP1BQ14684 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RRP1BQ14684 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RRP1BQ14684 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RRP1BQ14684 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RRP1BQ14684 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RRP1BQ14684 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RRP1BQ14684 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RRP1BQ14684 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RRP1BQ14684 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RRP1BQ14684 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RRP1BQ14684 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RRP1BQ14684 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RRP1BQ14684 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RRP1BQ14684 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RRP1BQ14684 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RRP1BQ14684 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RRP1BQ14684 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RRP1BQ14684 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RRP1BQ14684 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
RRP1BQ14684 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms