Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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