Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
BECN1Q14457 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
BECN1Q14457 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BECN1Q14457 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BECN1Q14457 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
BECN1Q14457 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
BECN1Q14457 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
BECN1Q14457 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BECN1Q14457 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BECN1Q14457 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BECN1Q14457 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BECN1Q14457 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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BECN1Q14457 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BECN1Q14457 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BECN1Q14457 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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BECN1Q14457 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BECN1Q14457 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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BECN1Q14457 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BECN1Q14457 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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BECN1Q14457 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BECN1Q14457 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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BECN1Q14457 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BECN1Q14457 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
BECN1Q14457 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BECN1Q14457 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
BECN1Q14457 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
BECN1Q14457 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BECN1Q14457 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
BECN1Q14457 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
BECN1Q14457 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BECN1Q14457 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BECN1Q14457 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BECN1Q14457 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BECN1Q14457 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BECN1Q14457 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BECN1Q14457 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
BECN1Q14457 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BECN1Q14457 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
BECN1Q14457 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BECN1Q14457 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BECN1Q14457 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
BECN1Q14457 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
BECN1Q14457 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
BECN1Q14457 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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