Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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