Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCINQ13939 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCINQ13939 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCINQ13939 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCINQ13939 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCINQ13939 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCINQ13939 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCINQ13939 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCINQ13939 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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CCINQ13939 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCINQ13939 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCINQ13939 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCINQ13939 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCINQ13939 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCINQ13939 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCINQ13939 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCINQ13939 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCINQ13939 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCINQ13939 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCINQ13939 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCINQ13939 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCINQ13939 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCINQ13939 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCINQ13939 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCINQ13939 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCINQ13939 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCINQ13939 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCINQ13939 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCINQ13939 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCINQ13939 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCINQ13939 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCINQ13939 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCINQ13939 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCINQ13939 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
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CCINQ13939 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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CCINQ13939 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CCINQ13939 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CCINQ13939 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CCINQ13939 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
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CCINQ13939 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CCINQ13939 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
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CCINQ13939 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CCINQ13939 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CCINQ13939 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
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