Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
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