Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.41□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.41□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.41□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.4□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.39□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms