Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
IKZF1Q13422 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
IKZF1Q13422 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
IKZF1Q13422 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
IKZF1Q13422 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
IKZF1Q13422 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
IKZF1Q13422 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
IKZF1Q13422 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
IKZF1Q13422 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
IKZF1Q13422 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
IKZF1Q13422 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
IKZF1Q13422 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
IKZF1Q13422 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
IKZF1Q13422 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
IKZF1Q13422 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
IKZF1Q13422 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
IKZF1Q13422 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
IKZF1Q13422 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
IKZF1Q13422 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
IKZF1Q13422 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
IKZF1Q13422 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
IKZF1Q13422 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
IKZF1Q13422 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
IKZF1Q13422 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
IKZF1Q13422 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
IKZF1Q13422 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
IKZF1Q13422 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
IKZF1Q13422 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
IKZF1Q13422 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
IKZF1Q13422 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
IKZF1Q13422 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
IKZF1Q13422 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
IKZF1Q13422 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
IKZF1Q13422 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
IKZF1Q13422 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.78
IKZF1Q13422 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
IKZF1Q13422 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
IKZF1Q13422 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms