Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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