Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
AP3B2Q13367 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.5 ms