Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATMQ13315 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATMQ13315 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATMQ13315 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATMQ13315 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATMQ13315 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATMQ13315 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATMQ13315 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATMQ13315 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATMQ13315 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATMQ13315 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATMQ13315 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATMQ13315 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATMQ13315 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATMQ13315 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATMQ13315 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATMQ13315 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATMQ13315 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATMQ13315 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATMQ13315 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATMQ13315 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATMQ13315 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATMQ13315 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATMQ13315 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATMQ13315 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATMQ13315 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATMQ13315 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATMQ13315 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATMQ13315 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATMQ13315 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATMQ13315 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATMQ13315 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATMQ13315 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATMQ13315 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATMQ13315 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATMQ13315 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATMQ13315 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATMQ13315 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATMQ13315 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATMQ13315 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATMQ13315 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATMQ13315 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATMQ13315 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATMQ13315 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATMQ13315 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATMQ13315 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATMQ13315 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATMQ13315 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATMQ13315 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATMQ13315 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATMQ13315 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATMQ13315 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATMQ13315 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATMQ13315 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATMQ13315 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATMQ13315 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATMQ13315 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATMQ13315 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATMQ13315 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
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