Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTGDRQ13258 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms