Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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