Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
PRDM2Q13029 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
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