Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXO1Q12778 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms