Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.3 ms