Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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HOXA4Q00056 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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HOXA4Q00056 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
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HOXA4Q00056 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
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HOXA4Q00056 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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HOXA4Q00056 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXA4Q00056 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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