Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
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PGGT1BP53609 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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PGGT1BP53609 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
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PGGT1BP53609 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
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PGGT1BP53609 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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PGGT1BP53609 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
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PGGT1BP53609 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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