Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CENPFP49454 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CENPFP49454 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC-0.47□□□□□ -2.48
CENPFP49454 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CENPFP49454 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
CENPFP49454 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC-0.47□□□□□ -2.48
CENPFP49454 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
CENPFP49454 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
CENPFP49454 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
CENPFP49454 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC-0.47□□□□□ -2.49
CENPFP49454 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CENPFP49454 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CENPFP49454 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CENPFP49454 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CENPFP49454 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
CENPFP49454 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
CENPFP49454 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
CENPFP49454 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CENPFP49454 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CENPFP49454 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CENPFP49454 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CENPFP49454 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CENPFP49454 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CENPFP49454 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC-0.48□□□□□ -2.49
CENPFP49454 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CENPFP49454 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
CENPFP49454 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CENPFP49454 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CENPFP49454 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CENPFP49454 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
CENPFP49454 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
CENPFP49454 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
CENPFP49454 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CENPFP49454 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CENPFP49454 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
CENPFP49454 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CENPFP49454 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
CENPFP49454 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CENPFP49454 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
CENPFP49454 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
CENPFP49454 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CENPFP49454 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CENPFP49454 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CENPFP49454 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CENPFP49454 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CENPFP49454 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CENPFP49454 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CENPFP49454 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CENPFP49454 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CENPFP49454 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CENPFP49454 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CENPFP49454 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CENPFP49454 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
CENPFP49454 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CENPFP49454 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CENPFP49454 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CENPFP49454 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
CENPFP49454 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CENPFP49454 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CENPFP49454 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC-0.5□□□□□ -2.49
CENPFP49454 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CENPFP49454 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CENPFP49454 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
CENPFP49454 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
CENPFP49454 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPFP49454 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPFP49454 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPFP49454 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPFP49454 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPFP49454 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPFP49454 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPFP49454 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPFP49454 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPFP49454 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPFP49454 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPFP49454 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPFP49454 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPFP49454 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPFP49454 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPFP49454 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPFP49454 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPFP49454 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPFP49454 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
CENPFP49454 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC-0.52□□□□□ -2.49
CENPFP49454 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CENPFP49454 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CENPFP49454 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
CENPFP49454 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
CENPFP49454 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CENPFP49454 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CENPFP49454 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CENPFP49454 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CENPFP49454 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
CENPFP49454 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CENPFP49454 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CENPFP49454 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CENPFP49454 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
CENPFP49454 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CENPFP49454 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CENPFP49454 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.6 ms