Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRMP28827 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRMP28827 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRMP28827 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRMP28827 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRMP28827 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRMP28827 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
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PTPRMP28827 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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PTPRMP28827 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
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PTPRMP28827 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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PTPRMP28827 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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PTPRMP28827 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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PTPRMP28827 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRMP28827 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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PTPRMP28827 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRMP28827 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
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PTPRMP28827 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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