Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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PTPRBP23467 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
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PTPRBP23467 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
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PTPRBP23467 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
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PTPRBP23467 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
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PTPRBP23467 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
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PTPRBP23467 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
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PTPRBP23467 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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