Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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