Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CRXO43186 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CRXO43186 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CRXO43186 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CRXO43186 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CRXO43186 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CRXO43186 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CRXO43186 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CRXO43186 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CRXO43186 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CRXO43186 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CRXO43186 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CRXO43186 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CRXO43186 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CRXO43186 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
CRXO43186 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
CRXO43186 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CRXO43186 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CRXO43186 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CRXO43186 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CRXO43186 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CRXO43186 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CRXO43186 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CRXO43186 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CRXO43186 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CRXO43186 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CRXO43186 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CRXO43186 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CRXO43186 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CRXO43186 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CRXO43186 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CRXO43186 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CRXO43186 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CRXO43186 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CRXO43186 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CRXO43186 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CRXO43186 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CRXO43186 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CRXO43186 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CRXO43186 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CRXO43186 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CRXO43186 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CRXO43186 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CRXO43186 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CRXO43186 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CRXO43186 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CRXO43186 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CRXO43186 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CRXO43186 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CRXO43186 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CRXO43186 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.21
CRXO43186 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.21
CRXO43186 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CRXO43186 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CRXO43186 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CRXO43186 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CRXO43186 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CRXO43186 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CRXO43186 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CRXO43186 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CRXO43186 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CRXO43186 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CRXO43186 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CRXO43186 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CRXO43186 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CRXO43186 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CRXO43186 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CRXO43186 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CRXO43186 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CRXO43186 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CRXO43186 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CRXO43186 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CRXO43186 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CRXO43186 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CRXO43186 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CRXO43186 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CRXO43186 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CRXO43186 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CRXO43186 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CRXO43186 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CRXO43186 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CRXO43186 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CRXO43186 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CRXO43186 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CRXO43186 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CRXO43186 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CRXO43186 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CRXO43186 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CRXO43186 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CRXO43186 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CRXO43186 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CRXO43186 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CRXO43186 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
CRXO43186 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CRXO43186 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CRXO43186 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CRXO43186 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CRXO43186 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CRXO43186 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CRXO43186 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
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