Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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FOXQ1Q9C009 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
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FOXQ1Q9C009 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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FOXQ1Q9C009 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
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FOXQ1Q9C009 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
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FOXQ1Q9C009 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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