Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP43Q70EL4 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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