Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
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PTPROQ16827 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
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PTPROQ16827 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
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PTPROQ16827 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
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PTPROQ16827 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
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PTPROQ16827 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
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PTPROQ16827 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
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