Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms