Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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ZNF239Q16600 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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ZNF239Q16600 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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