Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms