Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC1.43□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms