Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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