Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.3 ms