| CCDC6 | Q16204 | AC002545.1-201 | ENST00000592511 | 181 nt | BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AP002826.1-201 | ENST00000608835 | 315 nt | BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| CCDC6 | Q16204 | MIR663AHG-231 | ENST00000609044 | 590 nt | TSL 5 BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| CCDC6 | Q16204 | SDR42E1P2-201 | ENST00000614861 | 481 nt | BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AL360181.4-201 | ENST00000621752 | 134 nt | BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| CCDC6 | Q16204 | U6.114-201 | ENST00000636407 | 96 nt | BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| CCDC6 | Q16204 | ATM-228 | ENST00000639240 | 498 nt | TSL 5 BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC009812.4-201 | ENST00000569134 | 1805 nt | BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| CCDC6 | Q16204 | HTR2B-201 | ENST00000258400 | 2246 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| CCDC6 | Q16204 | TAB3P1-202 | ENST00000452645 | 1634 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.94 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC069228.1-201 | ENST00000546936 | 1615 nt | TSL 3 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.94 | | |
| CCDC6 | Q16204 | MTND4P14-201 | ENST00000435799 | 1354 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.94 | | |
| CCDC6 | Q16204 | MUC15-201 | ENST00000281268 | 2968 nt | TSL 5 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.94 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AGTR1-208 | ENST00000475347 | 1669 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | Y_RNA.157-201 | ENST00000363638 | 102 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNU4-48P-201 | ENST00000365559 | 182 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | GSTA3-202 | ENST00000370968 | 775 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | Y_RNA.384-201 | ENST00000383909 | 102 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNU6-754P-201 | ENST00000391166 | 107 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | MIR548F5-201 | ENST00000408421 | 86 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNU2-39P-201 | ENST00000410604 | 198 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNU6-373P-201 | ENST00000411247 | 98 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | TRAPPC2P4-201 | ENST00000421750 | 331 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | LINC00844-201 | ENST00000432535 | 477 nt | TSL 2 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
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| CCDC6 | Q16204 | RNU6-329P-201 | ENST00000459618 | 107 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC128713.1-201 | ENST00000471495 | 306 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AL138787.2-202 | ENST00000479395 | 385 nt | TSL 2 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | HSPE1P6-201 | ENST00000479457 | 291 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | ATP1B3-AS1-201 | ENST00000492725 | 376 nt | TSL 5 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | ENSA-210 | ENST00000503241 | 574 nt | TSL 3 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | CCDC34P1-201 | ENST00000507441 | 517 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNU6-559P-201 | ENST00000516151 | 98 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNU6-327P-201 | ENST00000516270 | 127 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNU2-10P-201 | ENST00000516375 | 211 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNU7-51P-201 | ENST00000516560 | 62 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNA5SP468-201 | ENST00000516782 | 93 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNU6-1088P-201 | ENST00000516850 | 104 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNA5SP503-201 | ENST00000517047 | 117 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AF117829.1-204 | ENST00000519854 | 284 nt | TSL 3 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC011979.2-201 | ENST00000527568 | 352 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC087241.2-201 | ENST00000535801 | 324 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC010175.1-201 | ENST00000538219 | 224 nt | TSL 5 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | TRAV1-1-201 | ENST00000542354 | 392 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | LINC02300-201 | ENST00000549742 | 665 nt | TSL 4 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AL445074.1-201 | ENST00000555362 | 318 nt | TSL 2 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC046158.1-201 | ENST00000563408 | 719 nt | TSL 3 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC026771.1-201 | ENST00000564672 | 415 nt | TSL 2 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC020910.1-201 | ENST00000599404 | 413 nt | TSL 5 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | uc_338.5-201 | ENST00000611839 | 155 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | uc_338.15-201 | ENST00000615470 | 191 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC007318.2-201 | ENST00000620999 | 243 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | DMD-201 | ENST00000288447 | 3856 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | CEP70-211 | ENST00000484888 | 1993 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | FKTN-204 | ENST00000448551 | 1700 nt | TSL 2 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | NAALADL2-203 | ENST00000454872 | 9865 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | ST7-AS2-206 | ENST00000456577 | 1351 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC073325.2-201 | ENST00000339545 | 159 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNU6-26P-201 | ENST00000383985 | 107 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNU6-474P-201 | ENST00000384243 | 107 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | Y_RNA.474-201 | ENST00000384341 | 102 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | Y_RNA.576-201 | ENST00000384781 | 102 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | MIR558-201 | ENST00000384920 | 94 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | MIR34A-201 | ENST00000385130 | 110 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNU4-26P-201 | ENST00000410270 | 107 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC092809.3-201 | ENST00000415453 | 231 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AL096701.2-201 | ENST00000416920 | 238 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC009161.1-201 | ENST00000417306 | 376 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RPL27AP8-201 | ENST00000424277 | 446 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | TOMM20P4-201 | ENST00000427861 | 435 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | KCNMA1-AS2-201 | ENST00000428936 | 427 nt | TSL 3 BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | ERLEC1P1-201 | ENST00000433806 | 578 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RPS29P6-201 | ENST00000438196 | 145 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | NEFMP1-201 | ENST00000443423 | 1006 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | IFNA11P-201 | ENST00000446352 | 526 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC104472.2-201 | ENST00000469035 | 601 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RN7SL297P-201 | ENST00000483161 | 293 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AL359273.1-202 | ENST00000505585 | 905 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | MTCO3P9-201 | ENST00000506989 | 781 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC104806.1-201 | ENST00000508720 | 308 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | SNORD60.2-201 | ENST00000516883 | 86 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AP005435.4-201 | ENST00000529514 | 284 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | BNIP3P6-201 | ENST00000549284 | 499 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | MIR4775-201 | ENST00000581168 | 75 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | APOOP1-201 | ENST00000604695 | 592 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC021646.1-201 | ENST00000605469 | 484 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | PART1_1.1-201 | ENST00000611761 | 217 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC130324.3-201 | ENST00000614165 | 542 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | SNHG22-203 | ENST00000617833 | 660 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC011155.2-201 | ENST00000623202 | 216 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RGPD6-201 | ENST00000329516 | 7165 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | GPBP1-201 | ENST00000264779 | 1786 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | OR9G4-204 | ENST00000641668 | 2608 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | FAM35BP-202 | ENST00000497389 | 3337 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | ANKRD26P2-201 | ENST00000445530 | 1710 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC091534.1-201 | ENST00000548779 | 1751 nt | TSL 2 BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | Y_RNA.31-201 | ENST00000362574 | 102 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNU6-1287P-201 | ENST00000362914 | 107 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNU6-512P-201 | ENST00000364438 | 103 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNU6-1060P-201 | ENST00000384664 | 107 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |