Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC0.49□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
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