Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
USF2Q15853 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
USF2Q15853 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
USF2Q15853 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
USF2Q15853 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
USF2Q15853 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
USF2Q15853 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
USF2Q15853 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC1.37□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
USF2Q15853 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
USF2Q15853 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
USF2Q15853 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
USF2Q15853 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
USF2Q15853 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
USF2Q15853 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
USF2Q15853 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
USF2Q15853 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
USF2Q15853 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
USF2Q15853 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
USF2Q15853 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
USF2Q15853 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
USF2Q15853 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
USF2Q15853 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
USF2Q15853 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
USF2Q15853 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
USF2Q15853 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
USF2Q15853 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
USF2Q15853 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
USF2Q15853 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
USF2Q15853 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
USF2Q15853 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
USF2Q15853 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
USF2Q15853 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
USF2Q15853 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
USF2Q15853 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
USF2Q15853 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
USF2Q15853 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
USF2Q15853 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
USF2Q15853 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
USF2Q15853 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
USF2Q15853 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
USF2Q15853 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
USF2Q15853 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
USF2Q15853 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
USF2Q15853 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
USF2Q15853 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
USF2Q15853 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
USF2Q15853 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
USF2Q15853 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
USF2Q15853 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
USF2Q15853 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
USF2Q15853 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
USF2Q15853 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
USF2Q15853 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
USF2Q15853 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
USF2Q15853 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
USF2Q15853 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
USF2Q15853 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
USF2Q15853 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
USF2Q15853 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
USF2Q15853 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
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