Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC0.03□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC0□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC0□□□□□ -2.41
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