Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.01□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.7 ms