Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHHQ15465 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SHHQ15465 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SHHQ15465 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SHHQ15465 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SHHQ15465 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SHHQ15465 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SHHQ15465 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SHHQ15465 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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SHHQ15465 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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SHHQ15465 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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